余伟师

64个博士“众筹”基因大数据分析,识基因寻“癌”踪

在10年前,基因测序成本约为几十亿美金;5年前乔布斯患上胰腺癌之时,做全基因测序的费用已经降到了十万美金;到2015年,全基因测序成本进一步降到了1000美金。

64个博士“众筹”基因大数据分析,识基因寻“癌”踪

赛福基因创始人余伟师

基因测序是国际公认的基因检测标准。作为精准医疗的重要手段,基因测序能锁定个人病变基因。

在10年前,基因测序成本约为几十亿美金;5年前乔布斯患上胰腺癌之时,做全基因测序的费用已经降到了十万美金;到2015年,全基因测序成本进一步降到了1000美金。

虽然基因测序成本的下降速度非常快,但对基因数据的分析还没有跟上。

每个人都有23000多个基因,相应的全基因测序数据结果可达几百GB到1TB之间。如何在基因突变与已知疾病之间建立关系,需要基因大数据与疾病大数据之间的相关性分析。这难在一方面需要大数据分析能力,另一方面还需要跨学科知识指导。

数据分析需要一个数学模型作为初始起点,再用大数据对这个数学模型不断进行优化。对于数据分析来说,有三个通用数学模型:统计模型、神经网络和专家知识系统。其中前二者偏向纯数学方式且需要海量计算,而专家知识系统则结合了行业专业知识,在提高分析效率的同时减少了计算量。

十年前,还在读硕士的余伟师就已经开始研究基因与疾病、基因与癌症的关系。他于2005至2010年先后在国际知名杂志上发表了7篇基因表达与健康及疾病相关的论文。2010年底,余伟师从华东师大生物医学专业

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